Компания «Данон» была создана в 1919 году в Барселоне на базе компании Исаака Карассо. Первый йогурт под названием «Данон» разработал Исаак Карассо. Этот йогурт продавался в аптеках, и его использовали для лечения детей при кишечных расстройствах. Исаак Карассо заинтересовался исследованиями молочных ферментов Ильи Мечникова, который в области медицины был лауреатом Нобелевской премии в 1908 году, а также деятельностью института Pasteur в Париже. Штаммы молочнокислых йогуртовых культур в виде болгарской палочки и термофильного стрептококка Карассо заказал в Испанию из Института Пастера. Впоследствии сын Исаака Даниэль, в честь которого была названа компания, продолжил начатое дело отца во Франции.
Две компании «Данон» и Gervais объединились в 1957 году, и эта новая компания создала новые типы молочных продуктов. Основоположником сегодняшней группы «Данон» является Антуан Рибу, который являлся главой компании по производству стекла BSN. Антуан Рибу был инициатором слияния компаний BSN и Gervais Danone, и таким образом был создан самый крупный пищевой бизнес во Франции. Затем компания перестала выпускать стекло, и сфокусировалась на продуктах питания и напитках, и в своем сегменте заняла третье место в Европе. Во многих направлениях в 1990-е годы работала компания «Данон», они изготавливали печенье, вермишель, воду, йогурты кондитерские изделия, пиво, блюда, готовые к употреблению, и многое другое.
В 1996 году компанию возглавил сын Антуана Франк Рибу, он начал расширять бизнес в другие страны. Компания сфокусировалась на трех основных направлениях, таких как: вода, свежие молочные продукты и печенье. Продукция компании производится не только в Западной Европе, но и в Азии, Восточной Европе, Северной и Южной Америке, Африке. В 2007 году компания «Данон» соединилась с голландской компанией Royal Numico, которая занимается изготовлением детского и медицинского питания, и является одной из ведущих компаний в мире. Таким образом, компания выполняет свою миссию, то есть несет здоровье через питание большому количеству людей.